La forma más sencilla de analizar una célula eucariota es como lo hace un patólogo al examinar un corte de tejido: primero se identifican las estructuras, luego se deduce la función a partir de la estructura y, finalmente, se prevé qué fallo ocurriría si dicha estructura se viera alterada. En una micrografía electrónica, comience por los elementos más grandes y distintivos y avance hacia el interior.
Utilice la micrografía etiquetada para practicar siempre el mismo recorrido de observación: límite celular, núcleo, membranas internas, orgánulos energéticos y compartimentos de degradación.
Las membranas hacen más que separar espacios. Definen qué lado de una proteína está orientado hacia el citosol, y dicha orientación se preserva durante el tráfico vesicular. Por esta razón, la topología permite diagnosticar problemas en las rutas celulares mejor que la simple ubicación de un orgánulo dentro de la célula.
En la ruta secretora, el lumen es el espacio acuoso interior delimitado por una membrana, mientras que el citosol es el espacio acuoso situado fuera de dichas membranas. Los lúmenes del retículo endoplásmico (RE), del aparato de Golgi, de las vesículas de transporte y de los lisosomas son compartimentos topológicamente equivalentes. Todos ellos están separados del citosol por una membrana y mantienen la misma orientación a medida que se desplaza la carga.
La envoltura nuclear es una membrana doble. Su complejo del poro nuclear actúa como puerta de paso que permite el tránsito de proteínas y ARN seleccionados, al tiempo que mantiene compartimentadas la cromatina y numerosas enzimas. La membrana nuclear externa es continua con el RE rugoso, motivo por el cual los ribosomas pueden estar presentes en ambas estructuras.
Analice los cortes transversales e identifique qué cara es citosólica y cuál es luminal antes de asignar una función a cualquier proteína de membrana.
Regla de oro Si un dominio proteico es luminal en el retículo endoplásmico (RE), permanecerá luminal en el aparato de Golgi y en el interior de las vesículas secretoras. No pasará espontáneamente al citosol sin un mecanismo de cruce de membrana.
Cuando un orgánulo falla, el fenotipo a menudo refleja un cuello de botella en el flujo de materia o de información.
Asocia los patrones descritos en los casos con el orgánulo que mejor los explique desde un punto de vista mecanístico, y no meramente por asociación.