तरल पानी बहता है, भाप बनकर उड़ता है, और नमक व चीनी को घोल देता है, लेकिन यह खाना पकाने वाले तेल को नहीं घोलता। ये साफ़ दिखने वाले अंतर इस बात से आते हैं कि पानी के मॉलिक्यूल इलेक्ट्रॉन कैसे शेयर करते हैं और उनके आंशिक चार्ज (partial charges) आस-पास के कणों को कैसे खींचते हैं। जब आप घुलने जैसी बड़ी घटना को कणों के मॉडल और फिर केमिकल फ़ॉर्मूले से जोड़ पाते हैं, तो आप उस मुख्य आदत को अपना लेते हैं जिसे यह कोर्स विकसित करेगा।
पानी के एक मॉलिक्यूल का आकार मुड़ा हुआ होता है और इसके O से H बॉन्ड में इलेक्ट्रॉन की शेयरिंग असमान होती है, इसलिए ऑक्सीजन थोड़ा नेगेटिव और हर हाइड्रोजन थोड़ा पॉजिटिव होता है। चार्ज का यह असमान बंटवारा ही पोलैरिटी है, और यह पानी को दूसरे पोलर मॉलिक्यूल और व जैसे आयनों के साथ जुड़ने में मदद करता है।
यह समझने के लिए कि आंशिक चार्ज कैसे हाइड्रोजन बॉन्ड का नेटवर्क बनाते हैं, मॉलिक्यूलर व्यू को देखें और पता करें कि कौन से एटम एक-दूसरे को आकर्षित करते हैं।
हाइड्रोजन बॉन्ड एक आंशिक रूप से पॉजिटिव हाइड्रोजन (जो O या N से कोवेलेंट बॉन्ड से जुड़ा होता है) और दूसरे O या N पर मौजूद लोन पेयर के बीच का आकर्षण है। लिक्विड पानी में, कई कमजोर हाइड्रोजन बॉन्ड बनते और टूटते रहते हैं, जिससे एक डायनामिक नेटवर्क बनता है। यह नेटवर्क इतने छोटे मॉलिक्यूल के हाई बॉइलिंग पॉइंट और चार्ज्ड व पोलर सॉल्यूट्स के मजबूत सॉल्वेशन को समझाने में मदद करता है।
संरक्षण (Conservation) के बारे में याद रखें जब हम बाद में पानी में रिएक्शन लिखेंगे, तो हर इक्वेशन के दोनों तरफ एटम और कुल चार्ज संरक्षित (कंजर्व्ड) रहने चाहिए।
फंक्शनल ग्रुप मॉलिक्यूल के अंदर एटम का एक खास पैटर्न होता है जो अनुमान लगाने योग्य गुण और रिएक्शन देता है, जैसे हाइड्रॉक्सिल , कार्बोक्सिल , और अमीनो । जब कार्बोक्सिल ग्रुप खो देता है तो यह बन जाता है, और वह नेगेटिव चार्ज पानी के मॉलिक्यूल के प्रति आकर्षण को बढ़ाता है।
चार्ज किसी आयन या मॉलिक्यूलर ग्रुप का एक होल नंबर गुण है, जबकि पोलैरिटी एक न्यूट्रल मॉलिक्यूल के अंदर आंशिक चार्ज का अलग-अलग होना है। हाइड्रोफोबिक इफेक्ट नॉन-पोलर सतहों की पानी में एक साथ इकट्ठा होने की प्रवृत्ति है, क्योंकि जब नॉन-पोलर एरिया कम से कम होता है तो पानी के मॉलिक्यूल अधिक अनुकूल हाइड्रोजन बॉन्डिंग व्यवस्था बनाते हैं। मॉलिक्यूलर रिकग्निशन आकार और इंटरैक्शन (जैसे आयन-आयन आकर्षण, हाइड्रोजन बॉन्डिंग, और डिस्पर्शन फोर्स) से प्रेरित चुनिंदा बाइंडिंग है।
मॉलिक्यूल की संरचना यह तय करती है कि इलेक्ट्रॉन कहाँ हो सकते हैं, जिससे आंशिक चार्ज तय होते हैं, और इससे यह तय होता है कि कौन से इंटरैक्शन इतने मजबूत हैं कि मायने रखें। उदाहरण के लिए, इथेनॉल पानी में घुल जाता है क्योंकि इसका ग्रुप हाइड्रोजन बॉन्ड बना सकता है, जबकि हेक्सेन नहीं घुलता क्योंकि यह पानी के साथ मजबूत आकर्षण नहीं बना सकता।
घुलनशीलता, बॉइलिंग पॉइंट और बाइंडिंग स्ट्रेंथ के आधार पर उदाहरणों को छांटकर मैक्रोस्कोपिक गुणों की तुलना उनके मॉलिक्यूलर स्तर के कारणों से करें।