A maneira mais fácil de analisar uma célula eucariótica é como um patologista examina um corte de tecido. Primeiro, identifique as estruturas; depois, deduza a função a partir da estrutura e preveja as falhas decorrentes de alterações nessa estrutura. Em uma micrografia eletrônica, comece pelos elementos de referência maiores e siga em direção ao interior.
Utilize a micrografia com legendas para praticar sempre a mesma sequência de análise: limite celular, núcleo, membranas internas, organelas energéticas e compartimentos de degradação.
As membranas fazem mais do que separar espaços. Elas definem qual lado de uma proteína está voltado para o citosol, e essa orientação é preservada durante o tráfego de vesículas. É por isso que a topologia permite diagnosticar problemas nas vias celulares melhor do que apenas a localização de uma organela na célula.
Na via secretora, o lúmen é o espaço aquoso interno delimitado por uma membrana, e o citosol é o espaço aquoso situado fora dessas membranas. O lúmen do RE, o lúmen do Golgi, o lúmen das vesículas de transporte e o lúmen dos lisossomos são compartimentos topologicamente equivalentes. Todos eles estão separados do citosol por uma membrana e mantêm a mesma orientação espacial à medida que a carga é transportada.
O envoltório nuclear consiste em uma membrana dupla. O seu complexo do poro nuclear atua como uma via de passagem que permite a travessia de proteínas e RNAs selecionados, mantendo, ao mesmo tempo, a cromatina e diversas enzimas compartimentalizadas. A membrana nuclear externa é contínua com o RE rugoso; é por isso que ambos podem apresentar ribossomos em sua superfície.
Analise os cortes transversais e identifique qual face é citosólica e qual é luminal antes de atribuir uma função a qualquer proteína de membrana.
Regra de ouro Se um domínio proteico estiver voltado para o lúmen no RE, ele permanecerá voltado para o lúmen no Golgi e no interior de vesículas secretoras. Ele não se tornará citosólico espontaneamente sem um mecanismo de transposição de membrana.
Quando uma organela falha, o fenótipo frequentemente reflete um gargalo no fluxo de matéria ou de informação.
Associe os padrões descritos nos cenários à organela que melhor os explica mecanisticamente, e não apenas por associação.