یوکیریوٹک سیل کا جائزہ لینے کا سب سے آسان طریقہ وہی ہے جو ایک پیتھالوجسٹ ٹشو (بافت) کے ٹکڑے کو پڑھتے ہوئے اپناتا ہے۔ پہلے ساختوں کی شناخت کریں، پھر ساخت کی بنیاد پر فعل کا اندازہ لگائیں، اور پھر اس بات کا تعین کریں کہ اگر وہ ساخت متاثر ہو تو کیا خرابی پیدا ہوگی۔ الیکٹران مائیکروگراف پر، سب سے نمایاں حصوں (landmarks) سے شروعات کریں اور اندر کی طرف بڑھیں۔
لیبل شدہ مائیکروگراف کا استعمال کرتے ہوئے ہر بار اسی ترتیب سے جائزہ لینے کی مشق کریں: بیرونی حد، نیوکلیئس، اندرونی جھلیاں، توانائی فراہم کرنے والے آرگنیلز، اور تحلیل کرنے والے حصے (degradative compartments)۔
جھلیاں صرف مختلف حصوں کو الگ کرنے کا کام نہیں کرتیں۔ وہ یہ تعین کرتی ہیں کہ پروٹین کا کون سا رخ سائٹو سول (cytosol) کی طرف ہے، اور ویسیکل (vesicle) کی نقل و حمل کے دوران یہ رخ برقرار رہتا ہے۔ یہی وجہ ہے کہ خلیے میں کسی آرگنیل (organelle) کے مقام کے مقابلے میں ‘ٹوپولوجی’ (ساختی ترتیب) کے ذریعے میٹابولک راستے (pathway) کے مسائل کی بہتر تشخیص کی جا سکتی ہے۔
سیکریٹری پاتھ وے (secretory pathway) میں، لیومن (lumen) جھلی سے گھرا ہوا اندرونی آبی حصہ ہوتا ہے، جبکہ سائٹو سول ان جھلیوں کے باہر موجود آبی حصہ ہے۔ ER کا لیومن، گولجی (Golgi) کا لیومن، ٹرانسپورٹ ویسیکل کا لیومن اور لائسوسوم (lysosome) کا لیومن ٹوپولوجیکل اعتبار سے یکساں خانے (compartments) ہیں۔ یہ سب ایک جھلی کے ذریعے سائٹو سول سے الگ ہوتے ہیں اور کارگو (مواد) کی نقل و حرکت کے دوران اپنا رخ برقرار رکھتے ہیں۔
نیوکلیئر انویلپ (nuclear envelope) ایک دوہری جھلی ہے۔ اس کا نیوکلیئر پور کمپلیکس (nuclear pore complex) وہ دروازہ ہے جو مخصوص پروٹینز اور آر این اے (RNAs) کو گزرنے کی اجازت دیتا ہے جبکہ کروماٹن (chromatin) اور بہت سے انزائمز کو الگ خانوں میں محدود رکھتا ہے۔ نیوکلیئس کی بیرونی جھلی رف اینڈوپلازمک ریٹیکولم (rough ER) کے ساتھ جڑی ہوئی ہوتی ہے، اسی لیے رائبوسومز (ribosomes) دونوں پر موجود ہو سکتے ہیں۔
کسی بھی جھلی والے پروٹین (membrane protein) کے فعل کا تعین کرنے سے پہلے، کراس سیکشنز (cross sections) کا بغور جائزہ لیں اور نشان زد کریں کہ کون سا رخ سائٹو سول کی طرف ہے اور کون سا لیومن کی طرف۔
سنہری اصول اگر کوئی پروٹین ڈومین اینڈوپلازمک ریٹیکولم (ER) کے اندرونی حصے (lumen) میں واقع ہے، تو یہ گولجی (Golgi) اور سیکریٹری ویسیکلز (secretory vesicles) کے اندر بھی اسی حصے میں رہے گا۔ یہ جھلی (membrane) کو عبور کرنے والے میکانزم کے بغیر خود بخود سائٹو سول (cytosol) میں منتقل نہیں ہو سکتا۔
جب کوئی آرگنیل (organelle) ناکارہ ہو جاتا ہے، تو ظاہر ہونے والی کیفیت (phenotype) اکثر مادے یا معلومات کی ترسیل میں رکاوٹ کی عکاسی کرتی ہے۔
دی گئی صورتحال (vignette) کے نمونوں کا موازنہ اس آرگنیل سے کریں جو ان کی بہترین میکانکی وضاحت کرتا ہو، نہ کہ صرف کسی سطحی تعلق کی بنیاد پر۔